| R | Mannschaft | Sp | S | U | N | Tore | TD | P |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 19 | 10 | 5 | 5628 | 28 | 67 |
| 2. | FC St. Pauli | 34 | 20 | 4 | 10 | 7237 | 35 | 64 |
| 3. | FC Augsburg | 34 | 17 | 11 | 6 | 6040 | 20 | 62 |
| 4. | Fortuna Düsseldorf 1895 | 34 | 17 | 8 | 9 | 4831 | 17 | 59 |
| 5. | SC Paderborn 07 | 34 | 14 | 9 | 11 | 4949 | 0 | 51 |
| 6. | MSV Duisburg | 34 | 14 | 8 | 12 | 5146 | 0 | 50 |
| 7. | DSC Arminia Bielefeld4 Punkte Abzug wegen des Verstoßes gegen die Bestimmungen der Lizenzierungsordnung | 34 | 16 | 5 | 13 | 4841 | 0 | 49 |
| 8. | TSV 1860 München | 34 | 14 | 6 | 14 | 4345 | 0 | 48 |
| 9. | FC Energie Cottbus | 34 | 13 | 8 | 13 | 5549 | 0 | 47 |
| 10. | Karlsruher SC | 34 | 13 | 7 | 14 | 4345 | 0 | 46 |
| 11. | SpVgg Greuther Fürth | 34 | 12 | 8 | 14 | 5150 | 0 | 44 |
| 12. | 1. FC Union Berlin | 34 | 11 | 11 | 12 | 4245 | 0 | 44 |
| 13. | TSV Alemannia Aachen | 34 | 11 | 10 | 13 | 3741 | 0 | 43 |
| 14. | SC Rot-Weiß Oberhausen | 34 | 12 | 5 | 17 | 3852 | -14 | 41 |
| 15. | FSV Frankfurt 1899 | 34 | 9 | 11 | 14 | 2950 | -21 | 38 |
| 16. | FC Hansa Rostock | 34 | 10 | 6 | 18 | 3345 | -12 | 36 |
| 17. | TuS Koblenz 1911 | 34 | 7 | 10 | 17 | 3560 | -25 | 31 |
| 18. | Rot Weiss Ahlen | 34 | 5 | 7 | 22 | 1955 | -36 | 22 |